Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCBP3Q53F19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms