Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBK1Q52WX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms