Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC184Q52MB2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC184Q52MB2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC184Q52MB2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms