Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4orf46Q504U0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms