Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms