Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYTL3Q4VX76 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYTL3Q4VX76 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms