Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CERKLQ49MI3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CERKLQ49MI3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CERKLQ49MI3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CERKLQ49MI3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms