Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms