Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms