Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms