Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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