Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFE2Q16621 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms