Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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