Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F4Q16254 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms