Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNA2Q15822 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms