Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB35Q15286 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms