Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB3GAP1Q15042 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3GAP1Q15042 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms