Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCLAFQ15004 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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