Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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