Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNQ14247 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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