Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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