Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
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