Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CDK13Q14004 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
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