Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.8■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SHROOM2Q13796 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
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