Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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TUBB3Q13509 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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TUBB3Q13509 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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TUBB3Q13509 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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TUBB3Q13509 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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