Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SKP2Q13309 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP2Q13309 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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