Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CLN3Q13286 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLN3Q13286 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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