Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDRQ13258 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDRQ13258 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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