Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPA4Q13156 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPA4Q13156 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms