Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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