Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT88Q13099 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
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IFT88Q13099 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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IFT88Q13099 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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IFT88Q13099 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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IFT88Q13099 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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IFT88Q13099 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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IFT88Q13099 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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IFT88Q13099 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT88Q13099 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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