Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CDC16Q13042 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms