Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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