Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms