Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DQ08499 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms