Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRTAP1-1Q07627 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms