Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 TIR2YOR010C 756 nt3.14□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 CSM4YPL200W 471 nt3.14□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 snR35snR35 204 nt3.14□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SHG1YBR258C 429 nt3.14□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 BSC1YDL037C 987 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 snR9snR9 187 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 FRQ1YDR373W 573 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SLD5YDR489W 885 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SPT2YER161C 1002 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 VAR1Q0140 1197 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 GIC1YHR061C 945 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YAP5YIR018W 738 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 TMA19YKL056C 504 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 COX19YLL018C-A 297 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YMR181CYMR181C 465 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YDR089WYDR089W 2610 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 TMA108YIL137C 2841 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 DUN1YDL101C 1542 nt3.13□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 VTC4YJL012C 2166 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YAK1YJL141C 2424 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 LST4YKL176C 2487 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 IRC3YDR332W 2070 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 CAF130YGR134W 3369 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 snR84snR84 550 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 ARF1YDL192W 546 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 RPA14YDR156W 414 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 GRX2YDR513W 432 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 MTC7YEL033W 420 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 PUG1YER185W 912 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SGN1YIR001C 753 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 GIS2YNL255C 462 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 GCY1YOR120W 939 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YOR364WYOR364W 369 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 CUR1YPR158W 759 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 BEM4YPL161C 1902 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SLM2YNL047C 1971 nt3.12□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YMR018WYMR018W 1545 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YDL016CYDL016C 303 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 PEA2YER149C 1263 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YGL039WYGL039W 1047 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SAE2YGL175C 1038 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 THG1YGR024C 714 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 BCD1YHR040W 1101 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SRP21YKL122C 504 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SEC14YMR079W 915 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YNL184CYNL184C 327 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 GAL7YBR018C 1101 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 RPC40YPR110C 1008 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 NDC80YIL144W 2076 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YKL075CYKL075C 1353 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 CHA4YLR098C 1947 nt3.11□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 RAD4YER162C 2265 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 HDA2YDR295C 2025 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 MDN1YLR106C 14733 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 MGT1YDL200C 567 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 VMA10YHR039C-A 345 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YJL119CYJL119C 324 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 RPL17BYJL177W 555 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 RPS21AYKR057W 264 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 NYV1YLR093C 762 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 ATP19YOL077W-A 207 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 MSN1YOL116W 1149 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 VHR1YIL056W 1923 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YEL025CYEL025C 3567 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 CPA2YJR109C 3357 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 ASI3YNL008C 2031 nt3.1□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 MIT1YEL007W 2001 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 SRD1YCR018C 666 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 NTF2YER009W 378 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 USE1YGL098W 738 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YHR212CYHR212C 336 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YIL141WYIL141W 390 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 ASG7YJL170C 630 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 VMA5YKL080W 1179 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 GTT2YLL060C 702 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 YAR060CYAR060C 336 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 LTP1YPR073C 486 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 ARG5,6YER069W 2592 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 JJJ1YNL227C 1773 nt3.09□□□□□ -1.91
SSK1Q07084 PFK26YIL107C 2484 nt3.09□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 TCB3YML072C 4638 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 DRS2YAL026C 4068 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SYO1YDL063C 1863 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 PSF1YDR013W 627 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YDR262WYDR262W 819 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SMX2YFL017W-A 234 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 AGE2YIL044C 897 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 AIM26YKL037W 357 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 PAI3YMR174C 207 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YOL114CYOL114C 609 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 AUS1YOR011W 4185 nt3.08□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 STU2YLR045C 2667 nt3.07□□□□□ -1.92
SSK1Q07084 SRP68YPL243W 1800 nt3.07□□□□□ -1.92
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