Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME1Q06323 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms