Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN11Q06124 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN11Q06124 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms