Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CALD1Q05682 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALD1Q05682 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms