Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE3AQ05086 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE3AQ05086 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms