Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP7AQ04656 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP7AQ04656 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP7AQ04656 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms