Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 TMA64YDR117C 1698 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 CET1YPL228W 1650 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 BRR6YGL247W 594 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 YGR190CYGR190C 366 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 YIL024CYIL024C 570 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 YAP5YIR018W 738 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 LSM8YJR022W 330 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 TRM112YNR046W 408 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 SSP2YOR242C 1116 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 YOR283WYOR283W 693 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 MSB1YOR188W 3414 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 CWH41YGL027C 2502 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 RLI1YDR091C 1827 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 AVT2YEL064C 1443 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 GCD10YNL062C 1437 nt1.91□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 YBT1YLL048C 4986 nt1.9□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 RPN4YDL020C 1596 nt1.9□□□□□ -2.1
YHP1Q04116 VHR1YIL056W 1923 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 TSC13YDL015C 933 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YGL138CYGL138C 1038 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RPC17YJL011C 486 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 HRT3YLR097C 1035 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ATG34YOL083W 1239 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ARF3YOR094W 552 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 IAH1YOR126C 717 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 IRC3YDR332W 2070 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PSP1YDR505C 2526 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ORC2YBR060C 1863 nt1.9□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 MSH4YFL003C 2637 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RIM13YMR154C 2184 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 NUF2YOL069W 1356 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YJR061WYJR061W 2808 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YCR015CYCR015C 954 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RNH202YDR279W 1053 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YLR311CYLR311C 348 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 SUB1YMR039C 879 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ATP3YBR039W 936 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RPN3YER021W 1572 nt1.89□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 SAK1YER129W 3429 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PHO2YDL106C 1680 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 NSE3YDR288W 912 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 DUO1YGL061C 744 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YGL159WYGL159W 1113 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 MRPL9YGR220C 810 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YKR070WYKR070W 1059 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PAU23YLR037C 375 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YMR187CYMR187C 1296 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 POL30YBR088C 777 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 TMN3YER113C 2121 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ENP2YGR145W 2124 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YDR061WYDR061W 1620 nt1.88□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 FIR1YER032W 2631 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 BOI1YBL085W 2943 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 VPS9YML097C 1356 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 FAR11YNL127W 2862 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 KRE33YNL132W 3171 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 SMC6YLR383W 3345 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 HMO1YDR174W 741 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 CIR1YGR207C 786 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PAU14YIL176C 363 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PAU1YJL223C 363 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 CDC123YLR215C 1083 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RPS1AYLR441C 768 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 POS5YPL188W 1245 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ALG14YBR070C 714 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 VTC3YPL019C 2508 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 NUP170YBL079W 4509 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 DUG2YBR281C 2637 nt1.87□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YEF3YLR249W 3135 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 SCD5YOR329C 2619 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RRG1YDR065W 1098 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YDR222WYDR222W 1248 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 SCL1YGL011C 759 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 GET1YGL020C 708 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YGR168CYGR168C 1131 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PCL7YIL050W 858 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ASG7YJL170C 630 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 MCR1YKL150W 909 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YML047W-AYML047W-A 366 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 AIM32YML050W 936 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YBL055CYBL055C 1257 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 END3YNL084C 1050 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 PEX17YNL214W 600 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RFC5YBR087W 1065 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YSA1YBR111C 696 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 WHI3YNL197C 1986 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 VPS13YLL040C 9435 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YGL176CYGL176C 1665 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YNL011CYNL011C 1335 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 SCP160YJL080C 3669 nt1.86□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 ARI1YGL157W 1044 nt1.85□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 RPS29AYLR388W 171 nt1.85□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 YNL035CYNL035C 1170 nt1.85□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 HRT1YOL133W 366 nt1.85□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 STN1YDR082W 1485 nt1.85□□□□□ -2.11
YHP1Q04116 UBP15YMR304W 3693 nt1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 110.6 ms