Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOP2BQ02880 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOP2BQ02880 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOP2BQ02880 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms