Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB1Q02641 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms