Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms