Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MC1RQ01726 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MC1RQ01726 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms