Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEX3Q00994 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms