Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDM2Q00987 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms