Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLTCQ00610 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLTCQ00610 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLTCQ00610 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms